【佳學(xué)基因檢測】如何找到更多的找到影響骨關(guān)節(jié)炎發(fā)病的基因檢測位點(diǎn)并提供臨床服務(wù)
 

骨關(guān)節(jié)炎風(fēng)險(xiǎn)基因突變序列的鑒定：

骨關(guān)節(jié)炎基因檢測位點(diǎn)研究團(tuán)隊(duì)對來自 9 個(gè)人群的 13 個(gè)國際隊(duì)列的多達(dá) 826,690 人（177,517 名骨關(guān)節(jié)炎患者）的基因突變與骨關(guān)節(jié)炎發(fā)生的關(guān)系進(jìn)行了 GWAS 基因檢測薈萃分析。與迄今為止賊大的骨關(guān)節(jié)炎 GWAS 基因檢測分析相比，骨關(guān)節(jié)炎患者數(shù)量增加到2.3 倍。其中兩個(gè)隊(duì)列是東亞人，11 個(gè)隊(duì)列是歐洲人后裔。在進(jìn)行分析時(shí)，骨關(guān)節(jié)炎基因檢測位點(diǎn)分析團(tuán)隊(duì)將骨關(guān)節(jié)炎患者分成了 11 種表型組，涵蓋骨關(guān)節(jié)炎的所有主要部位（圖 1；STAR 方法）。骨關(guān)節(jié)炎基因檢測位點(diǎn)分析團(tuán)隊(duì)使用 p < 1.3 × 10-8 的閾值發(fā)現(xiàn)了 11,897 個(gè)全基因組顯著相關(guān)的單核苷酸變異 (SNV)，以說明獨(dú)立測試的有效數(shù)量。骨關(guān)節(jié)炎基因檢測位點(diǎn)分析團(tuán)隊(duì)在表型內(nèi)應(yīng)用了條件分析并確定了 223 個(gè)獨(dú)立關(guān)聯(lián)，其中一些在表型之間重疊（圖 1；表 1）。這一次分析增加了 84 個(gè)基因檢測位點(diǎn)，它們在骨關(guān)節(jié)炎基因檢測位點(diǎn)分析團(tuán)隊(duì)分析之前沒有被確定為與骨關(guān)節(jié)炎之間存在相關(guān)性。骨關(guān)節(jié)炎基因檢測位點(diǎn)分析團(tuán)隊(duì)還在這一數(shù)據(jù)分析中數(shù)據(jù)庫中已經(jīng)存在的骨關(guān)節(jié)炎基因檢測位點(diǎn)，在數(shù)據(jù)中存在的96個(gè)位點(diǎn)，其中 87 個(gè)骨關(guān)節(jié)炎基因檢測位點(diǎn)在如何影響骨關(guān)節(jié)這一關(guān)聯(lián)上得到進(jìn)一步的證實(shí)。

基因檢測位點(diǎn)的分析結(jié)構(gòu)圖

 
(A) 骨關(guān)節(jié)炎基因檢測位點(diǎn)分析時(shí)對骨關(guān)節(jié)炎的11 種臨床分類：關(guān)節(jié)炎表型、性別特異性分析、它們之間的關(guān)系及其樣本量（病例/對照）的概述。 TKR，全膝關(guān)節(jié)置換術(shù)； THR，全髖關(guān)節(jié)置換術(shù)。
 
(B) 所有 11 種檢查的骨關(guān)節(jié)炎表型的所有個(gè)體薈萃分析結(jié)果的合并曼哈頓圖。 虛線表示全基因組顯著性閾值 p = 1.3 × 10−8。
 
(C) 所有主要全基因組顯著獨(dú)立骨關(guān)節(jié)炎相關(guān)單核苷酸變異 (SNV) 及其相關(guān)的骨關(guān)節(jié)炎表型的圖形概述。
 

表1:所有全基因組顯著骨關(guān)節(jié)炎相關(guān) SNV 的總結(jié)結(jié)果

 

全基因組關(guān)聯(lián)研究	病例/對照	信號	新信號	已知信號
所有骨關(guān)節(jié)炎	177,517/649,173	21	8	13
膝關(guān)節(jié)和/或髖關(guān)節(jié)骨關(guān)節(jié)炎	89,741/400,604	31	9	22
髖骨關(guān)節(jié)炎	36,445/316,943	45	17	28
膝關(guān)節(jié)骨性關(guān)節(jié)炎	62,497/333,557	24	11	13
全髖關(guān)節(jié)置換術(shù)	23,021/296,016	38	12	26
全膝關(guān)節(jié)置換術(shù)	18,200/233,841	10	4	6
全關(guān)節(jié)置換	40,887/327,689	37	12	25
手骨關(guān)節(jié)炎	20,901/282,881	7	5	2
手指骨關(guān)節(jié)炎	10,804/255,814	5	3	2
拇指骨關(guān)節(jié)炎	10,536/236,919	4	2	2
脊柱骨關(guān)節(jié)炎	28,3721/3057,578	1	1	0
全部的		223	84	139
跨表型的總獨(dú)立信號c		100	52	48
性別分析
女性全髖關(guān)節(jié)置換術(shù)	11,089/67,516	2	2	0
女性全骨關(guān)節(jié)炎	90,838/192,697	1	1	0
早發(fā)性骨關(guān)節(jié)炎分析
早期所有骨關(guān)節(jié)炎	6,838/41,449	1	1	0

此處報(bào)告的信號是全基因組顯著的 (p < 1.3 × 10 ^-8 )，早發(fā)分析除外 (p < 5 × 10 ^-8 )。
^a病例是任何部位的骨關(guān)節(jié)炎：髖、膝、手、手指、拇指和脊柱。
^b信號數(shù)基于定義的骨關(guān)節(jié)炎表型，新的/已知的基于先前報(bào)告的骨關(guān)節(jié)炎位點(diǎn)。
^c在骨關(guān)節(jié)炎表型內(nèi)部和之間計(jì)算的獨(dú)立性，主要 SNV 被分配給賊重要的表型。
 

表 2:100 個(gè)獨(dú)立的全基因組顯著 SNV 的匯總統(tǒng)計(jì)

 

骨關(guān)節(jié)炎表型	其他骨關(guān)節(jié)炎表型	SNV	位置：位置	EA	能源局	電爐	或者	95% 可信區(qū)間	p	注解	賊近的基因	權(quán)重組
新的 SNV
手指OA		RS11588154	1:55301936	噸	G	0.17	0.83	0.79–0.88	6.08 × 10 -10	內(nèi)含子	C1orf177	2個(gè)
髖關(guān)節(jié)OA	蘇氨酸	rs4411121	1:118757034	噸	C	0.31	1.07	1.05–1.09	2.16 × 10 -11	基因間	SPAG17	0
蘇氨酸	HipOA、TJR	rs1327123	1:184014593	C	G	0.35	0.91	0.89–0.93	2.44 × 10 -16	基因間	泉15	0
拇指OA		RS11588850	1:227927242	一個(gè)	G	0.82	0.87	0.84–0.91	3.53 × 10 -10	內(nèi)含子	SNAP47	2個(gè)
膝髖骨關(guān)節(jié)炎	膝骨關(guān)節(jié)炎	rs74676797	2:633063	一個(gè)	G	0.82	1.05	1.03–1.07	6.39 × 10 -10	基因間	TMEM18	0
蘇氨酸	髖關(guān)節(jié)OA	rs66989638	2:106689736	一個(gè)	G	0.13	1.12	1.08–1.15	3.31 × 10 -11	內(nèi)含子	C2orf40	1個(gè)
蘇氨酸		rs2276749	3:11643465	噸	C	0.05	0.86	0.82–0.90	3.34 × 10 -9	錯(cuò)義p.Ile37Met	VGLL4	1個(gè)
全OA		rs62242105	3:20630395	一個(gè)	G	0.33	0.97	0.96–0.98	2.93 × 10 -9	基因間	RNU6-815P	北美
髖關(guān)節(jié)OA		rs781661531	3:187051013	噸	C	7 × 10 -4	0.11	0.05-0.21	8.36 × 10 -11	基因間	RTP4	北美
髖關(guān)節(jié)OA		rs747952496	3:188311659	一個(gè)	G	4 × 10 -4	7.02	3.93–12.55	4.91 × 10 -11	內(nèi)含子	LPP	北美
髖關(guān)節(jié)OA		RS9835230	3:189735461	一個(gè)	G	0.24	1.07	1.04–1.09	1.34 × 10 -9	內(nèi)含子	LEPREL1	1個(gè)
全OA	SpineOA	rs201194999	4:66666895	噸	C	0.3	0.88	0.85–0.92	3.05 × 10 -9	基因間	RNU2-40P	1個(gè)
全OA		rs11729628	4:121584282	噸	G	0.24	0.97	0.96–0.98	4.74 × 10 -9	基因間	RP11-501E14.1	北美
蘇氨酸		RS75686861	4:145621328	一個(gè)	G	0.09	1.12	1.08–1.16	3.04 × 10 -9	內(nèi)含子	HHIP	0
膝骨關(guān)節(jié)炎		rs2066928	5:30843787	一個(gè)	G	0.48	0.96	0.95–0.97	1.20 × 10 -8	基因間	RPL19P11	1個(gè)
蘇氨酸	髖關(guān)節(jié)OA	rs56132153	5:67825133	一個(gè)	C	0.61	1.07	1.05–1.09	3.80 × 10 -9	內(nèi)含子	CTC-537E7.1	0
手辦OA		rs1560080	5:115338732	一個(gè)	G	0.83	0.91	0.88–0.94	9.61 × 10 -9	內(nèi)含子	水質(zhì)PEP	1個(gè)
膝髖骨關(guān)節(jié)炎	TJR、AllOA、HipOA、THR	rs17615906	5:128018413	噸	C	0.84	0.95	0.93–0.96	3.76 × 10 -11	內(nèi)含子	SLC27A6	1個(gè)
手辦OA	拇指骨關(guān)節(jié)炎、膝骨關(guān)節(jié)炎	rs10062749	5:141805088	噸	G	0.27	1.08	1.06–1.11	2.04 × 10 -09	內(nèi)含子	AC005592.2	1個(gè)
手指OA	手辦OA	RS9396861	6:18404133	一個(gè)	C	0.61	1.13	1.09–1.17	9.35 × 10 -11	內(nèi)含子	RNF144B	2個(gè)
臺積電		rs2038740	6:35114542	噸	C	0.72	0.94	0.93–0.96	6.20 × 10 -10	內(nèi)含子	TCP11	1個(gè)
臺積電		rs116934101	7:101775597	一個(gè)	G	0.27	1.106	1.04–1.08	7.12 × 10 -9	內(nèi)含子	CUX1	1個(gè)
全OA		rs12667224	7:114024316	一個(gè)	G	0.52	0.97	0.96–0.98	1.66 × 10 -9	內(nèi)含子	FOXP2	北美
膝髖骨關(guān)節(jié)炎		rs571734653	7:137143697	一個(gè)	C	3 × 10 -4	6.03	3.30–11.03	5.56 × 10 -9	內(nèi)含子	DGKI	北美
TKR		rs7787744	7:150521096	一個(gè)	G	0.67	1.08	1.05–1.11	1.29 × 10 -9	上游基因	AOC1	0
臺積電		rs76340814	9:98321412	一個(gè)	G	0.05	0.89	0.86–0.92	1.87 × 10 -9	基因間	RP11-332M4.1	0
蘇氨酸	HipOA、TJR、膝關(guān)節(jié)OA	RS79895530	9:110416422	噸	C	0.13	0.88	0.85–0.91	3.86 × 10 -14	基因間	RNU6-996P	0
髖關(guān)節(jié)OA		rs7862601	9:118343026	一個(gè)	G	0.62	0.94	0.92–0.96	6.19 × 10 -9	基因間	RP11-284G10.1	0
髖關(guān)節(jié)OA		rs10983775	9:120521100	噸	C	0.54	0.95	0.93–0.97	4.65 × 10 -9	基因間	RP11-281A20.2	0
髖關(guān)節(jié)OA		rs10465114	9:129917824	一個(gè)	G	0.22	1.06	1.04–1.09	9.04 × 10 -9	內(nèi)含子	RALGPS1	0
蘇氨酸	髖關(guān)節(jié)OA	rs3740129	10:73767859	一個(gè)	G	0.46	1.08	1.05–1.10	1.70 × 10 -11	錯(cuò)義 p.Arg357Gln	CHST3	0
臺積電		rs10824456	10:78615458	C	G	0.58	10.95	0.94–0.97	1.16 × 10 -8	基因間	KCNMA1	1個(gè)
手辦OA	蘇氨酸	rs3993110	11:12794530	一個(gè)	C	0.61	1.09	1.06–1.11	3.75 × 10 -11	內(nèi)含子	TEAD1	1個(gè)
膝髖骨關(guān)節(jié)炎		rs1631174	11:47974373	一個(gè)	C	0.34	1.04	1.03–1.05	7.28 × 10 -9	監(jiān)管區(qū)域	PTPRJ	1個(gè)
TKR	膝骨關(guān)節(jié)炎	rs72979233	11:74355523	一個(gè)	G	0.75	0.92	0.89–0.95	2.52 × 10 -9	內(nèi)含子	POLD3	1個(gè)
臺積電	AllOA、膝關(guān)節(jié)OA、HipOA、THR	rs10831475	11:95796907	一個(gè)	G	0.81	1.08	1.05–1.10	5.89 × 10 -12	內(nèi)含子	MAML2	1個(gè)
膝髖骨關(guān)節(jié)炎	膝骨關(guān)節(jié)炎、全膝關(guān)節(jié)置換術(shù)	rs10842226	12:23959589	一個(gè)	G	0.42	1.04	1.03–1.06	4.68 × 10 -10	內(nèi)含子	SOX5	1個(gè)
TKR	膝骨關(guān)節(jié)炎	rs7967762	12:48420214	噸	C	0.16	1.11	1.07–1.15	4.41 × 10 -10	上游基因	RP1-228P16.4	1個(gè)
膝骨關(guān)節(jié)炎		rs1426371	12:108629780	一個(gè)	G	0.27	10.95	0.93–0.97	8.86 × 10 -10	內(nèi)含子	WSCD2	0
膝骨關(guān)節(jié)炎		rs58973023	13:42959133	一個(gè)	噸	0.49	1.06	1.04–1.08	4.72 × 10 -10	基因間	FABP3P2	1個(gè)
臺積電		rs28929474	14:94844947	噸	C	0.02	0.81	0.76–0.86	1.06 × 10 -10	錯(cuò)義p.Glu366Gln	SERPINA1	0
蘇氨酸	髖關(guān)節(jié)OA	rs746239049	15:63067433	丁	我	0.21	0.90	0.87–0.93	8.19 × 10 -12	內(nèi)含子	TLN2	0
膝骨關(guān)節(jié)炎		rs12914479	15:99174828	C	G	0.66	1.04	1.03–1.06	7.12 × 10 -9	基因間	RP11-35O15.1	0
膝骨關(guān)節(jié)炎		rs6500609	16:4515334	C	G	0.11	0.94	0.91–0.96	5.16 × 10 -9	內(nèi)含子	NMRAL1	1個(gè)
臺積電		rs227732	17:54769890	噸	C	0.3	1.06	1.04–1.09	1.61 × 10 -9	基因間	木栓	0
膝髖骨關(guān)節(jié)炎	HipOA, AllOA	RS9908159	17:54841961	噸	C	0.51	1.04	1.03–1.05	4.44 × 10 -11	基因間	C17orf67	1個(gè)
全OA		rs1039257158	18:77950448	噸	C	6 × 10 -4	3.62	2.35–5.60	6.56 × 10 -9	內(nèi)含子	PARD6G	北美
膝髖骨關(guān)節(jié)炎		rs551471509	19:9943264	噸	C	6 × 10 -4	0.18	0.10–0.32	1.15 × 10 -8	上游基因	CTD-2623N2.11	北美
手辦OA	手指OA	rs8112559	19:46390455	C	G	0.89	1.13	1.09–1.18	7.32 × 10 -11	上游基因	IRF2BP1	2個(gè)
臺積電		rs9981884	21:40585633	一個(gè)	G	0.49	0.95	0.94–0.97	7.93 × 10 -9	內(nèi)含子	BRWD1	1個(gè)
膝骨關(guān)節(jié)炎		rs11705555	22:28206912	一個(gè)	C	0.76	1.05	1.03–1.07	3.00 × 10 -9	監(jiān)管區(qū)域	MN1	1個(gè)
蘇氨酸	TJR、HipOA	rs12160491	22:38195796	一個(gè)	G	0.71	0.93	0.90–0.95	1.28 × 10 -10	基因間	H1F0	0
此前報(bào)道
髖關(guān)節(jié)OA	THR、TJR、AllOA、KneeHipOA	rs11164653	1:103464210	噸	C	0.41	0.92	0.91–0.94	2.77 × 10 -18	內(nèi)含子	COL11A1	1個(gè)
全OA		1:150214028	1:150214028	丁	我	0.38	1.04	1.02–1.05	8.58 × 10 -10	基因間	RNU2-17P	北美
臺積電		rs10797923	1:183901966	噸	C	0.69	1.05	1.04–1.07	6.20 × 10 -9	內(nèi)含子	科爾加特2	0
臺積電	膝關(guān)節(jié)骨關(guān)節(jié)炎、膝關(guān)節(jié)骨關(guān)節(jié)炎、髖關(guān)節(jié)骨關(guān)節(jié)炎、THR	rs2605100	1:219644224	一個(gè)	G	0.32	1.07	1.05–1.09	4.49 × 10 -15	基因間	RP11-95P13.1	1個(gè)
膝髖骨關(guān)節(jié)炎	膝骨關(guān)節(jié)炎	rs7581446	2:33423801	噸	C	0.48	0.95	0.94–0.97	4.87 × 10 -11	內(nèi)含子	LTBP1	1個(gè)
全OA	HipOA、TJR、THR、ThumbOA、KneeHipOA、HandOA	rs3771501	2:70717653	一個(gè)	G	0.47	1.04	1.03–1.05	4.05 × 10 -15	內(nèi)含子	TGFA	北美
全OA		rs62182810	2:204387482	一個(gè)	G	0.54	1.03	1.02–1.04	3.82 × 10 -9	內(nèi)含子	RAPH1	北美
蘇氨酸	膝髖骨關(guān)節(jié)炎、TJR、髖關(guān)節(jié)骨關(guān)節(jié)炎	rs3774354	3:52817675	一個(gè)	G	0.37	1.10	1.07–1.12	1.40 × 10 -16	內(nèi)含子	ITIH1	0
臺積電	TKR、HipOA、AllOA、KneeOA、THR、KneeHipOA	rs1530586	4:1760927	噸	C	0.8	1.09	1.06–1.11	3.34 × 10 -14	監(jiān)管區(qū)域	TACC3	0
蘇氨酸	TJR、HipOA、KneeHipOA、AllOA	rs1913707	4:13039440	一個(gè)	G	0.6	1.09	1.06–1.11	1.23 × 10 -13	基因間	RNU6-962P	1個(gè)
全OA	HipOA, 膝關(guān)節(jié)OA	rs13107325	4:103188709	噸	C	0.07	1.08	1.06–1.10	3.25 × 10 -17	錯(cuò)義p.Ala391Thr	SLC39A8	0
膝髖骨關(guān)節(jié)炎	髖關(guān)節(jié)OA	rs3884606	5:170871074	一個(gè)	G	0.52	0.96	0.95–0.97	8.96 × 10 -10	內(nèi)含子	FGF18	1個(gè)
髖關(guān)節(jié)OA		rs79220007	6:26098474	噸	C	0.93	0.90	0.87–0.93	2.22 × 10 -9	3_prime_UTR	高爐	0
膝髖骨關(guān)節(jié)炎		rs2856821	6:33046742	噸	C	0.79	1.11	1.03–1.06	5.71 × 10 -9	內(nèi)含子	HLA-DPA1	0
蘇氨酸	膝髖骨關(guān)節(jié)炎、髖關(guān)節(jié)骨關(guān)節(jié)炎、TJR	rs17288390	6:45384018	噸	C	0.65	0.92	0.90–0.94	9.16 × 10 -13	內(nèi)含子	運(yùn)行X2	0
蘇氨酸	HipOA、TJR	RS9475400	6:55638258	噸	C	0.1	1.15	1.10–1.19	1.73 × 10 -13	內(nèi)含子	BMP5	0
蘇氨酸	HipOA、TJR	rs12209223	6:76164589	一個(gè)	C	0.11	1.22	1.18–1.26	1.92 × 10 -29	內(nèi)含子	菲利普1	1個(gè)
髖關(guān)節(jié)OA	蘇氨酸	rs111844273	7:18436337	一個(gè)	G	0.02	1.26	1.18–1.34	1.05 × 10 -12	內(nèi)含子	HDAC9	0
蘇氨酸	髖關(guān)節(jié)OA	rs143083812	7:128843410	噸	C	1.1 × 10 -3	3.30	2.34–4.66	1.11 × 10 -11	錯(cuò)義p.Arg173Cys	SMO	北美
蘇氨酸	HipOA、TJR	rs11984666	8:130730280	一個(gè)	C	0.2	0.90	0.87–0.92	1.69 × 10 -15	基因間	RP11-274M4.1	0
膝髖骨關(guān)節(jié)炎	膝骨關(guān)節(jié)炎	rs10974438	9:4291928	一個(gè)	C	0.65	1.04	1.03–1.06	7.39 × 10 -11	內(nèi)含子	全球信息系統(tǒng)3	1個(gè)
膝髖骨關(guān)節(jié)炎	TKR, 膝骨關(guān)節(jié)炎, TJR, AllOA	rs72760655	9:116916214	一個(gè)	C	0.33	1.05	1.03–1.06	5.97 × 10 -13	上游基因	COL27A1	1個(gè)
蘇氨酸	髖關(guān)節(jié)OA	rs1330349	9:117840742	C	G	0.59	1.10	1.07–1.12	6.47 × 10 -17	內(nèi)含子	跨國公司	0
蘇氨酸	HipOA、TJR	rs1321917	9:119324929	C	G	0.41	1.10	1.08–1.13	9.87 × 10 -19	內(nèi)含子	ASTN2	1個(gè)
蘇氨酸	髖關(guān)節(jié)OA	rs62578126	9:129375338	噸	C	0.37	0.92	0.90–0.94	1.39 × 10 -12	內(nèi)含子	RP11-123K19.1	0
膝髖骨關(guān)節(jié)炎	臺積電	rs1517572	11:28829882	一個(gè)	C	0.41	1.04	1.03–1.05	6.79 × 10 -10	內(nèi)含子	RP11-115J23.1	1個(gè)
蘇氨酸	HipOA、TJR	rs67924081	11:65342981	一個(gè)	G	0.74	1.10	1.07–1.12	2.14 × 10 -13	上游基因	EHBP1L1	1個(gè)
蘇氨酸	髖關(guān)節(jié)OA	rs34560402	11:66872320	噸	C	0.06	0.86	0.82–0.90	2.64 × 10 -10	基因間	KDM2A型	0
膝髖骨關(guān)節(jié)炎		rs1149620	11:76506572	一個(gè)	噸	0.44	0.96	0.95–0.97	2.87 × 10 -9	內(nèi)含子	TSKU	1個(gè)
手指OA		rs7294636	12:15054016	一個(gè)	G	0.37	1.16	1.12–1.20	2.99 × 10 -16	內(nèi)含子	C12orf60	1個(gè)
蘇氨酸	TJR, 膝髖骨關(guān)節(jié)炎, 髖關(guān)節(jié)骨關(guān)節(jié)炎	rs10843013	12:28025196	一個(gè)	C	0.78	0.86	0.84–0.88	2.53 × 10 -30	基因間	RP11-993B23.1	0
蘇氨酸	髖關(guān)節(jié)OA	rs17120227	12:59289349	噸	C	0.07	1.17	1.12–1.22	7.21 × 10 -13	內(nèi)含子	LRIG3	0
膝髖骨關(guān)節(jié)炎	臺積電	rs7953280	12:94136009	C	G	0.5	1.04	1.03–1.06	4.84 × 10 -12	內(nèi)含子	CRADD	0
膝骨關(guān)節(jié)炎		rs753350451	12:123732769	丁	我	0.2	0.93	0.91–0.95	3.36 × 10 -10	內(nèi)含子	C12orf65	0
臺積電	HipOA、THR	rs1809889	12:124801226	噸	C	0.28	1.07	1.05–1.09	5.70 × 10 -14	下游基因	FAM101A	0
膝骨關(guān)節(jié)炎	膝髖骨關(guān)節(jié)炎	rs4380013	15:50759428	一個(gè)	G	0.19	1.06	1.04–1.08	8.73 × 10 -10	內(nèi)含子	USP8	1個(gè)
手辦OA	KneeOA、TKR、FingerOA、ThumbOA	rs11071366	15:58334244	一個(gè)	噸	0.61	0.90	0.88–0.92	4.88 × 10 -17	內(nèi)含子	乙醛脫氫酶1A2	1個(gè)
髖關(guān)節(jié)OA	TJR、THR、膝關(guān)節(jié)OA、AllOA	rs12908498	15:67366488	C	G	0.54	1.08	1.06–1.10	1.85 × 10 -16	內(nèi)含子	SMAD3	1個(gè)
膝髖骨關(guān)節(jié)炎	TJR, HipOA, 膝骨關(guān)節(jié)炎	RS9940278	16:53800200	噸	C	0.43	1.06	1.04–1.07	1.45 × 10 -18	內(nèi)含子	自由貿(mào)易組織	1個(gè)
膝骨關(guān)節(jié)炎	TKR	rs34195470	16:69955690	一個(gè)	G	0.45	0.95	0.94–0.96	3.13 × 10 -13	內(nèi)含子	WWP2	0
全OA	TKR、膝髖骨關(guān)節(jié)炎、膝骨關(guān)節(jié)炎	rs216175	17:2167690	一個(gè)	C	0.83	1.04	1.03–1.06	2.74 × 10 -12	內(nèi)含子	SMG6	北美
蘇氨酸	髖關(guān)節(jié)OA	rs7212908	17:59654593	一個(gè)	G	0.8	0.91	0.89–0.94	1.95 × 10 -11	基因間	NACA2	0
蘇氨酸	TJR、HipOA	rs2716212	17:67503653	一個(gè)	G	0.62	0.93	0.91–0.95	3.56 × 10 -10	內(nèi)含子	MAP2K6	0
全OA	膝骨關(guān)節(jié)炎	rs10405617	19:10752968	一個(gè)	G	0.32	1.03	1.02–1.04	9.33 × 10 -11	內(nèi)含子	SLC44A2	北美
臺積電	全OA	rs75621460	19:41833784	一個(gè)	G	0.03	1.21	1.14–1.28	2.72 × 10 -10	內(nèi)含子	轉(zhuǎn)化生長因子B1	1個(gè)
蘇氨酸	HipOA、TJR	rs4252548	19:55879672	噸	C	0.02	1.39	1.29–1.49	2.49 × 10 -19	錯(cuò)義p.Arg33His	IL11	1個(gè)
膝骨關(guān)節(jié)炎	AllOA、TJR、KneeHipOA、TKR	rs143384	20:34025756	一個(gè)	G	0.59	1.07	1.06–1.09	1.01 × 10 -23	5_prime_UTR	GDF5	1個(gè)
蘇氨酸	臺積電	RS9981408	21:40017446	噸	G	0.23	1.10	1.07–1.12	2.21 × 10 -12	內(nèi)含子	爾格	0
女性專用
蘇氨酸		rs116112221	2:59439973	噸	C	6.1 × 10 -3	1.95	1.58–2.41	4.61 × 10 -10	上游基因	FALCL1	北美
蘇氨酸		rs10282983	8:69590554	噸	C	0.22	1.15	1.11–1.19	2.21 × 10 -14	內(nèi)含子	C3ORF34	北美
全OA		rs10453201	9:34050345	噸	C	0.22	1.05	1.02–1.06	1.05 × 10 -8	上游基因	UBAP2	北美
早發(fā)性
全OA		rs148693048	8:24598320	噸	C	0.0012	6.26	3.26–12.00	3.37 × 10 -8	內(nèi)含子	NEFM	北美

縮寫：骨關(guān)節(jié)炎 (OA) 表型，與全基因組顯著關(guān)聯(lián)的 OA 表型 (p < 1.3 × 10 ^-8 ) 除了早發(fā)性分析 (p < 5 × 10 ^-8); 其他骨關(guān)節(jié)炎表型，在 GWS 水平上與此 SNV 相關(guān)但不如 OA 表型顯著的其他 OA 表型；AllOA，任何聯(lián)合站點(diǎn)的OA；KneeOA，膝關(guān)節(jié) OA；HipOA，髖骨關(guān)節(jié)炎；KneeHipOA、KneeOA 和/或 HipOA；TJR，全膝關(guān)節(jié)和/或髖關(guān)節(jié)置換術(shù)；TKR，全膝關(guān)節(jié)置換術(shù)；THR，全髖關(guān)節(jié)置換術(shù)；SpineOA，脊柱骨關(guān)節(jié)炎；FingerOA，手指的OA；ThumbOA，拇指骨關(guān)節(jié)炎；HandOA、FingerOA 和/或 ThumbOA；EA，效應(yīng)等位基因；NEA，無效應(yīng)等位基因；EAF，效應(yīng)等位基因頻率；或者，比值比；95% CI，OR 的 95% 置信區(qū)間；根據(jù) grch37 Ensembl REST API 的注釋，賊嚴(yán)重的后果，如果錯(cuò)義，則根據(jù)人類基因突變數(shù)據(jù)庫命名法提供氨基酸變化；NearestGene，根據(jù) grch37 Ensembl REST API 的賊近基因；WtGrp，信號屬于哪個(gè)負(fù)重組 (p < 5 × 10 ^-4 )，0 = 僅負(fù)重，1 = 負(fù)重和非負(fù)重，2 = 僅非負(fù)重，NA = 由于不完整而未分類所有表型、女性特定關(guān)聯(lián)或 AllOA 關(guān)聯(lián)的信息。
 
 
 
 

(責(zé)任編輯：佳學(xué)基因)