【佳學(xué)基因檢測(cè)】全基因組測(cè)序（WGS)基因檢測(cè)如何變靶罕見(jiàn)病的診斷
與全外顯子組測(cè)序 (WES) 相比，全基因組測(cè)序（WGS)基因檢測(cè)的主要優(yōu)勢(shì)之一是能夠分析基因組的非編碼區(qū)域。 非編碼DNA包含多種成分，包括重復(fù)序列（端粒、著絲粒、衛(wèi)星DNA）、編碼不同類(lèi)型非編碼RNA分子的序列以及眾多調(diào)控元件（啟動(dòng)子、增強(qiáng)子和沉默子）。 非編碼RNA分子和其他調(diào)控元件在基因表達(dá)控制中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。 這些基因組位點(diǎn)對(duì)于診斷多因素遺傳病特別重要。 全基因組測(cè)序（WGS)基因檢測(cè)允許對(duì)非編碼區(qū)域進(jìn)行詳細(xì)分析，從而提供識(shí)別可能影響基因調(diào)控并進(jìn)而影響疾病發(fā)展的變異的機(jī)會(huì)。
罕見(jiàn)疾病統(tǒng)稱(chēng)為罕見(jiàn)病，涵蓋 8000 多種獨(dú)特疾病，其中大多數(shù)源于遺傳起源，而佳學(xué)基因則將更多現(xiàn)在無(wú)法歸因于基因原因的遺傳性疾病納入全基因組測(cè)序致病基因鑒定的項(xiàng)目中，從而大大拓展了基因測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用。 雖然這些疾病中的每一種單獨(dú)發(fā)生的情況并不常見(jiàn)，但它們的綜合影響影響了相當(dāng)大的一部分人口，患病率在 6% 到 8% 之間。 作為 100,000 人基因組計(jì)劃的一部分進(jìn)行的一項(xiàng)研究表明，全基因組測(cè)序（WGS)基因檢測(cè)在為 25% 患有罕見(jiàn)疾病的參與者提供診斷方面發(fā)揮了關(guān)鍵作用。 這種創(chuàng)新方法證明了其能夠檢測(cè)傳統(tǒng)診斷方法可能無(wú)法檢測(cè)到的情況。 此外，賊近的一項(xiàng)研究揭示了針對(duì)個(gè)體患者定制 全基因組測(cè)序（WGS)基因檢測(cè)分析的潛力，這種做法可以顯著提高這些疾病的診斷率。 加速診斷對(duì)于某些罕見(jiàn)疾病尤其有價(jià)值，例如原發(fā)性線粒體疾病表型——由線粒體或核 DNA 突變引起的一系列遺傳性疾病。
基因組的非編碼區(qū)域構(gòu)成了個(gè)體DNA 的絕大多數(shù)（98.5%），長(zhǎng)期以來(lái)被認(rèn)為是“基因組垃圾”，因?yàn)樗鼈儾痪幋a蛋白質(zhì)。 然而，隨著人類(lèi)基因組計(jì)劃（HGP）的完成和下一代測(cè)序（NGS）技術(shù)的進(jìn)步尤其是基因解碼技術(shù)的引入，研究越來(lái)越表明基因組的非編碼區(qū)域在基因調(diào)控中發(fā)揮著關(guān)鍵作用，可以產(chǎn)生重大影響 疾病發(fā)作。 全基因組測(cè)序尤其提供了發(fā)現(xiàn)非編碼區(qū)域變異的機(jī)會(huì)，為理解兒童遺傳病的起源開(kāi)辟了新的視角。 全面的基因組分析可以揭示罕見(jiàn)遺傳性疾病的原因，包括線粒體疾病、神經(jīng)系統(tǒng)疾病、代謝紊亂、血液疾病以及骨骼和軟組織發(fā)育障礙，并評(píng)估糖尿病和兒童肥胖等多因素疾病的風(fēng)險(xiǎn)。 鑒于科學(xué)知識(shí)的不斷進(jìn)步，全基因組測(cè)序提供了發(fā)現(xiàn)可能導(dǎo)致疾病的新基因變化的能力。 通過(guò)二次發(fā)現(xiàn)，它還可以預(yù)防和及時(shí)治療并非測(cè)試賊初原因的健康問(wèn)題。 在兒科預(yù)防醫(yī)學(xué)的背景下，這種積極主動(dòng)的醫(yī)療保健可以產(chǎn)生更好的治療結(jié)果，并確保在需要具有挑戰(zhàn)性的治療的晚期疾病發(fā)生之前進(jìn)行疾病預(yù)防。
非編碼區(qū)域內(nèi)調(diào)控元件的突變導(dǎo)致基因表達(dá)的變化，這可以顯著影響表型表現(xiàn)和疾病發(fā)展。 例如，啟動(dòng)子、增強(qiáng)子或沉默子的突變可以影響轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合并改變特定基因的表達(dá)水平，導(dǎo)致疾病的發(fā)展。 通過(guò)全基因組測(cè)序（WGS）檢測(cè)調(diào)控區(qū)域的變異提供了識(shí)別導(dǎo)致兒童遺傳病的新變異的機(jī)會(huì)，而之前的分析未能確定編碼 DNA 的原因。 識(shí)別調(diào)控元件中的特定變異可以增強(qiáng)我們對(duì)潛在分子機(jī)制的理解。 這可以導(dǎo)致新治療靶點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)和新治療策略的開(kāi)發(fā)。 此外，非編碼區(qū)的基因變異可能對(duì)理解涉及多個(gè)基因和環(huán)境因素相互作用的復(fù)雜遺傳疾病具有影響。 例如，特定基因的變化可能會(huì)增加對(duì)某些環(huán)境因素的易感性，例如對(duì)幽門(mén)螺桿菌等感染的易感性，這可能導(dǎo)致胃潰瘍和胃癌等多因素疾病的風(fēng)險(xiǎn)增加。
臨床基因組分析可分為三個(gè)階段：一級(jí)分析、二級(jí)分析和三級(jí)分析。 初步分析涵蓋下一代測(cè)序的技術(shù)組成部分，包括 DNA 提取、文庫(kù)制備和初步樣品質(zhì)量控制。 二次分析涉及測(cè)序的生物信息數(shù)據(jù)處理，包括將獲得的序列與參考人類(lèi)基因組進(jìn)行比對(duì)以及額外的計(jì)算操作以糾正潛在的分析錯(cuò)誤。 賊后，三級(jí)分析涉及變異解釋?zhuān)ㄗ儺愖⑨?、過(guò)濾、臨床分類(lèi)、結(jié)果解釋以及生成用于基因檢測(cè)的醫(yī)學(xué)報(bào)告。 佳學(xué)基因檢測(cè)綜合應(yīng)用一級(jí)、二級(jí)和三級(jí)分析，特別關(guān)注臨床解釋和全基因組測(cè)序（WGS)基因檢測(cè)在日常臨床實(shí)踐中的應(yīng)用。
