【佳學基因檢測】布格替尼(Brigatinib)靶向藥物基因檢測

靶向藥物基因檢測導讀

NF2（2型神經(jīng)纖維瘤病）是一種常染色體顯性遺傳綜合征，由于NF2腫瘤抑制基因的突變引起，可能導致多發(fā)性神經(jīng)鞘瘤和腦膜瘤。目前尚無FDA批準的治療這類腫瘤的療法，因其持續(xù)進展而使患者面臨高發(fā)病率和死亡率。通過結(jié)合高通量篩選、臨床前體內(nèi)建模和大規(guī)模激酶組評估，腫瘤靶向藥物基因檢測確定了可行的藥物靶點和有效的實驗療法，以治療NF2相關(guān)的神經(jīng)鞘瘤和腦膜瘤。這些努力確認了ALUNBRIG®（布加替尼），一種FDA批準的多種酪氨酸激酶抑制劑（包括ALK），在已確診的NF2缺陷型異種移植腦膜瘤和自發(fā)性NF2神經(jīng)鞘瘤的基因工程小鼠模型中有效抑制腫瘤生長。令人驚訝的是，腦膜瘤和神經(jīng)鞘瘤細胞均不表達ALK。相反，靶向藥物基因檢測證明布加替尼抑制了多種酪氨酸激酶，包括EphA2、Fer和粘著斑激酶1（FAK1）。這些數(shù)據(jù)展示了從頭無偏藥物發(fā)現(xiàn)方法的強大潛力，并代表了治療NF2相關(guān)惡性腫瘤的重要進展。

腫瘤靶向藥物基因檢測著眼點

NF2（2型神經(jīng)纖維瘤病）是一種罕見的遺傳性疾病，由于NF2基因的雙等位基因缺失，導致神經(jīng)嵴來源的腫瘤發(fā)展。NF2基因編碼腫瘤抑制因子Merlin，其生化功能通過基因解碼基因檢測得以明確 。雙側(cè)前庭神經(jīng)鞘瘤是NF2的典型表現(xiàn)，該疾病也經(jīng)常與多發(fā)性腦膜瘤的發(fā)展相關(guān)聯(lián)。據(jù)基因解碼基因檢測的大數(shù)據(jù)分析，約90%的散發(fā)性神經(jīng)鞘瘤和60%的散發(fā)性腦膜瘤（人類最常見的顱內(nèi)腫瘤）存在NF2失活。在測有基因解碼基因檢測的指導，目前尚無FDA批準的藥物療法可治療這些常見且進展迅速的腫瘤。

在腫瘤的靶向藥物基因檢測分析中，腫瘤靶向藥物基因檢測采用了系統(tǒng)生物學方法：（1）利用高通量藥物篩選，識別FDA批準或后期開發(fā)的化合物，這些化合物可對抗Merlin缺陷型神經(jīng)鞘瘤和腦膜瘤細胞；（2）整合來自激酶組分析和轉(zhuǎn)錄組分析的數(shù)據(jù)，確定未來開發(fā)的優(yōu)先目標；（3）利用基因工程小鼠模型和腫瘤異種移植模型，為通過體外藥物篩選識別的一組化合物建立初步的臨床前療效數(shù)據(jù)，以便識別至少一種藥物進行臨床試驗。通過這種方法，腫瘤靶向藥物基因檢測確定了對NF2相關(guān)神經(jīng)鞘瘤和腦膜瘤治療有積極影響的單一藥物和組合藥物。尤其重要的是，腫瘤靶向藥物基因檢測在體外和臨床前動物模型中確認了FDA批準的多酪氨酸激酶抑制劑（TKI）布加替尼，作為Merlin缺陷型神經(jīng)鞘瘤和腦膜瘤生長的有效抑制劑。有趣的是，缺乏Merlin的神經(jīng)鞘瘤和腦膜瘤細胞不表達布加替尼的主要已知靶點ALK。相反，腫瘤靶向藥物基因檢測證明，這種化合物在機制上抑制了多種激酶，包括先前確認為NF2相關(guān)腫瘤中致癌蛋白的粘著斑激酶（FAK）。這些數(shù)據(jù)展示了一種有效的系統(tǒng)生物學方法，適用于罕見腫瘤的臨床前治療發(fā)現(xiàn)，并支持將布加替尼作為多TKI治療方案推進到治療NF2相關(guān)腦膜瘤和神經(jīng)鞘瘤的臨床試驗中。

靶向藥物基因檢測發(fā)現(xiàn)的藥物治療是否有效？

ALK-IN-1及其衍生物布加替尼與MK-2206或達沙替尼顯示出協(xié)同作用，分別抑制NF2缺陷型腦膜瘤和神經(jīng)鞘瘤細胞的活力。

ALK-IN-1是FDA批準的ALK抑制劑布格替尼（AP26113, ALUNBRIG®）的化學類似物。盡管ALK-IN-1已不再處于臨床開發(fā)階段，靶向藥物基因檢測比較了布格替尼與ALK-IN-1在與MK-2206或達沙替尼聯(lián)合使用時抑制NF2缺陷細胞活力的能力。布格替尼像ALK-IN-1一樣，抑制了NF2缺陷的Syn5蛛網(wǎng)膜和Ben-Men-1腦膜瘤細胞，以及兩種獨立的NF2缺失原發(fā)性腦膜瘤細胞系（MN612和MN621）的生長。當MK-2206單獨使用時，幾乎沒有生長抑制活性，但與布加替尼聯(lián)合使用時，在Ben-Men-1細胞中顯示出輕微的協(xié)同作用，以及在Syn5、MN612和MN621細胞中。

聯(lián)合使用ALK-IN-1和達沙替尼降低了人類雪旺細胞系的細胞活力，對NF2缺陷（HS01）細胞更為敏感。作為單一藥物，布格替尼抑制了小鼠Nf2-/-神經(jīng)鞘瘤MS02和人類NF2缺陷型HS01雪旺細胞的生長。小鼠MS02細胞對布格替尼的抑制更為敏感，與人類HS01細胞相比。與廣泛篩選中的ALK-IN-1類似，布格替尼與達沙替尼在降低HS01和MS02細胞活力方面表現(xiàn)出顯著的協(xié)同作用?；谶@些結(jié)果，布加替尼靶向藥物基因檢測進一步通過對治療細胞的轉(zhuǎn)錄組分析以及對體內(nèi)腫瘤生長的影響，評估了布加替尼單藥治療以及與MK-2206或達沙替尼聯(lián)合治療的效果。

靶向藥物基因檢測如何增加治療的有效性？

在靶向藥物基因檢測中，個性化治療行動小組采用了一種無偏見、系統(tǒng)化的方法，最終確認布加替尼作為治療NF2相關(guān)神經(jīng)鞘瘤和腦膜瘤的新型單藥療法。這項工作始于基于細胞的藥物篩選，使用了MIPE 4.0腫瘤學集合中的約2000種化合物。類似于其他同源NF2/Nf2表達細胞，ALK-IN-1被確定為對NF2缺陷的Syn5蛛網(wǎng)膜和HS01神經(jīng)鞘瘤細胞系具有強效選擇性抑制作用的藥物。由于ALK-IN-1最初是作為能抑制ALK的一系列結(jié)構(gòu)類似物中的一部分生成的，個性化治療行動小組選擇不直接將其作為治療方法。最終，這一系列分子的治療開發(fā)傾向于另一種結(jié)構(gòu)類似物AP26113，即布加替尼。個性化治療行動小組證實，布加替尼在減緩NF2缺陷的神經(jīng)鞘瘤和腦膜瘤細胞系生長方面表現(xiàn)出與ALK-IN-1相當?shù)寞熜А４送?，當與MK-2206聯(lián)合使用時，布加替尼在體外對腦膜瘤細胞的生長抑制表現(xiàn)出輕微的協(xié)同作用。

ALK-IN-1和達沙替尼聯(lián)合治療降低了人類SW01細胞系的細胞活力，而對NF2缺陷（HS01）細胞表現(xiàn)出更高的敏感性。作為單一藥物，布加替尼抑制了小鼠Nf2-/-神經(jīng)鞘瘤（MS02）和人類NF2缺陷型HS01神經(jīng)鞘瘤細胞的活力。MS02細胞顯示出比HS01細胞更高的對布加替尼抑制的敏感性。與廣泛篩選中的ALK-IN-1類似，布加替尼和達沙替尼在減少HS01和MS02細胞活力方面顯示出顯著的協(xié)同作用。基于這些發(fā)現(xiàn)，個性化治療行動小組通過分析治療細胞的轉(zhuǎn)錄組和評估其在體內(nèi)腫瘤生長上的影響，進一步評估了布加替尼作為單藥治療和與MK-2206聯(lián)合治療的效果。

個性化治療行動小組的研究強調(diào)了在目標疾病模型中進行激酶組分析的重要性，有助于識別潛在的并未預(yù)料到的藥物靶點。根據(jù)ALUNBRIG™提交給FDA的數(shù)據(jù)，個性化治療行動小組了解到，盡管布加替尼對ALK的IC50約為1nM，但它也能有效抑制ROS1和FLT3等多種RTK，以及FER、FAK/PTK2和BRK/PTK6等多種非RTK，表現(xiàn)出了廣泛的活性。這些結(jié)果支持了布加替尼作為治療NF2相關(guān)神經(jīng)鞘瘤和腦膜瘤的強大抗腫瘤活性。