【佳學基因檢測】PrediXcan 在表型與基因型研究中的應用
為了讓科研服務合作伙伴應用先進的生物信息學基礎,佳學基因介紹了通過QTL數據集(如GTEx, 在介紹時,佳學基因交替使用QTL和GTE,盡管這些分析方法可以在任何轉錄組學研究中使用)對GWAS變異序列進行協調使用和注釋的方法。
在全基因組關聯分析研究中(GWAS),存大著大量的、各異的數據信息,這些研究的特點是使用的平臺不同,注釋的方式不同,調用的參照基因組也互不相同。
佳學基因對PrediXcan系列分析方法時行了深入分析,并將其移植到新一代全基因組關聯分析研究中,以建立轉錄本和人體表征的關聯性。當變異位點和分析模型數量有限時,分析的效果在每一個轉錄組范圍內的分析方法中從總體上會降低。
這說明,在一個特定的GWAS分析中,參與分析基因位點可能與轉錄組分析模型不能很好地進行匹配,所以預測效果降低。佳學基因認為,在任何一種應用中,都需要考慮GWAS模型中的基因位點的變量交叉分析方式。
(責任編輯:佳學基因)