【佳學基因檢測】熒光原位雜交(FISH)在實體瘤診斷和個體化治療中的應用
熒光原位雜交基因檢測導讀:
熒光原位雜交(FISH)是一種重要的分子病理學檢測技術,通過使用熒光標記的DNA探針與組織或細胞中的特定基因或染色體區(qū)域雜交,可以檢測基因的數目、結構和位置等異常情況。
在實體瘤診斷方面,FISH技術主要用于:
鑒別腫瘤的類型和亞型,如通過檢測特定的基因重排(如EWSR1-FLI1在Ewing肉瘤中)進行分型。
評估預后相關的分子標志物,如HER2基因擴增在乳腺癌中與較差預后相關。
檢測腫瘤特征性的染色體異常,如慢性骨髓性白血病的費城染色體。
在個體化治療方面,FISH檢測結果可以指導靶向藥物的選擇:
檢測驅動基因的擴增或者過度表達,如EGFR、HER2等,可用于選擇相應的小分子靶向藥物或單克隆抗體。
檢測基因重排,如ALK、ROS1等,可用于選擇相應的酪氨酸激酶抑制劑。
檢測抗腫瘤藥物靶點的狀態(tài),如TOPO2A基因擴增可用于預測對蒽環(huán)類藥物的反應。
綜上所述,FISH技術為實體瘤的分子分型診斷和靶向治療藥物的正確使用提供了重要的分子依據,是現代正確腫瘤學不可或缺的分子病理檢測手段。
熒光原位雜交(FISH)是基因異常常規(guī)診斷中的標準技術
熒光原位雜交(FISH)是基因異常常規(guī)診斷中的標準技術。由于FISH操作簡單,佳學基因腫瘤基因檢測可以識別腫瘤特異性異常。其應用僅限于設計的探針類型?;蛑嘏牛鏏LK、ROS1反映多個易位伙伴,關鍵區(qū)域的缺失,例如1p和19q,基因融合,例如COL1A1-PDGFB,基因組失衡,例如6p、6q、11q和擴增,例如HER2,是個性化腫瘤學的目標。遺傳標記的確認通常是開始特定、靶向治療的直接指標。在其他情況下,檢測到的異常有助于病理學家更好地區(qū)分軟組織肉瘤,或作出賊終診斷。佳學基因的主要目標是表明,將FISH應用于福爾馬林固定石蠟包埋組織樣本(FFPE)可以評估來自原發(fā)性腫瘤或轉移瘤的細胞群中的基因組狀態(tài)。盡管有許多更先進的技術可供使用,例如實時PCR或新一代測序,但FISH仍然是許多遺傳實驗室中常用的方法。
熒光原位雜交(FISH)在實體瘤診斷和個體化治療中的應用關鍵詞
ALK;COL1A1-PDGFB;FISH;HER2;ROS1;個性化醫(yī)學;個性化腫瘤學;t(X,18);靶向治療。
佳學基因是如何理解熒光原位雜交技術的?
原位雜交篩查在個性化醫(yī)學中起到支持作用。多種已知的異?,F象,包括由易位、插入或倒位導致的重排、缺失(刪除)和增益(例如擴增),主要可以通過熒光原位雜交(FISH)來評估。在某些情況下,色原原位雜交(CISH)也被引入到分子病理學和分子腫瘤學領域。兩種原位雜交方法都基于相同的原理,即與感興趣的區(qū)域進行退火、檢測、評估和空間定位。這兩種方法的主要區(qū)別在于基因組區(qū)域的標記方法,可以使用生物素或地高辛(CISH),或者使用熒光標記(FISH),然后使用適當的檢測系統。對于用生物素標記的探針,使用與辣根過氧化物酶(HRP-鏈霉親和素)結合的鏈霉親和素進行檢測。對于帶有地高辛的探針,使用抗地高辛熒光素一抗,隨后使用與熒光素結合的HRP二抗,并在明場顯微鏡下計數信號。FISH檢測是直接進行的,需要熒光顯微鏡。遺傳標記的檢測通常在患者決策中起到關鍵作用,從患者風險分層到實施適當的治療。這兩種原位技術都用于該領域。例如,與FISH相比,CISH在檢測HER-2/neu基因擴增方面的靈敏度為97.5%,特異性為94%。在一組4460例乳腺癌患者的FISH和CISH結果的一致性率為96%,表明CISH是一種與FISH相當的技術。大多數資料都認為,在基因擴增檢測中,FISH和CISH的表現幾乎相同。然而,由于17號染色體的多體性,CISH對于低水平擴增的靈敏度可能較低。對于使用FISH和CISH檢測的ALK(ALK受體酪氨酸激酶)重排,也有類似的觀察結果。在對449個樣本的測試中,這兩種方法分別顯示出19個和18個ALK陽性樣本。CISH的靈敏度為94.4%,特異性為100%。雖然每種診斷工具,不僅基于雜交,還基于蛋白質表達,如免疫組織化學(IHC),都有其優(yōu)點和缺點,但FISH技術目前被認為是參考方法。
原位檢測的另一替代方法是使用mRNA作為生物標志物。該技術使用與測試的mRNA分子互補的單鏈DNA探針。標準程序包括消化、雜交、使用抗地高辛抗體和標記有HRP的二抗進行檢測,以及使用顯色劑(例如DAB,即3,3'-二氨基聯苯胺)和明場顯微鏡對結果進行可視化。與上述ISH技術相比,mRNAISH更快、更便宜、制備更容易且毒性更低??梢允褂眉从眯驮噭┖袑Ω栺R林固定石蠟包埋(FFPE)樣本中的乳腺癌HER2基因表達進行評估。與其他基于mRNA評估的技術一樣,其主要限制是核糖核酸的穩(wěn)定性較差。