【佳學(xué)基因檢測(cè)】心血管內(nèi)科的基因檢測(cè):遺傳咨詢和檢測(cè)項(xiàng)目建議
基因檢測(cè)旨在識(shí)別遺傳信息中的基因變異,從而確認(rèn)或者是否定對(duì)一病人的疾病表現(xiàn)所做出的判斷,預(yù)測(cè)嘗未出現(xiàn)的癥狀的疾病的發(fā)生,或者為醫(yī)療和生育決定提供風(fēng)險(xiǎn)估計(jì)。遺傳下來(lái)的變異不僅包括DNA和RNA的變化,還包括整個(gè)染色體、蛋白質(zhì)或某些代謝物的變化。明確基因檢測(cè)一類檢測(cè)內(nèi)容、檢測(cè)技術(shù)和檢測(cè)結(jié)果非常廣泛的。不同的基因檢測(cè)機(jī)構(gòu)、甚至是同一檢測(cè)機(jī)構(gòu)不同的上下文中會(huì)采用不同的含義。
診斷測(cè)試 |
確認(rèn)或排除醫(yī)生根據(jù)臨床觀察所懷疑的特定遺傳病的基因檢測(cè) |
產(chǎn)前檢查 |
在出生前進(jìn)行的測(cè)試,以確定胎兒受遺傳性 疾病影響的可能性。常見(jiàn)的產(chǎn)前診斷方法包括羊膜穿刺術(shù)和絨毛取樣(CVS) |
新生兒篩查 |
在新生兒期進(jìn)行的測(cè)試,以確定新生兒是否患有遺傳性代謝疾病。例如,苯丙酮尿癥(PKU) |
攜帶者檢測(cè) |
為確定無(wú)癥狀個(gè)體中是否存在突變而進(jìn)行的測(cè)試 |
預(yù)測(cè)測(cè)試 |
對(duì)無(wú)癥狀個(gè)體進(jìn)行測(cè)試,以提供有關(guān)其發(fā)生遺傳病風(fēng)險(xiǎn)的信息。包括癥狀前和易感/敏感性測(cè)試 |
發(fā)病前檢測(cè) |
為確定無(wú)癥狀個(gè)體是否攜帶遺傳病的突變而進(jìn)行的預(yù)測(cè)測(cè)試。陽(yáng)性結(jié)果表明患者將發(fā)展為該疾病,但沒(méi)有具體說(shuō)明發(fā)病時(shí)間。亨廷頓病 |
易感/敏感性測(cè)試 |
進(jìn)行預(yù)測(cè)性測(cè)試,以確定無(wú)癥狀個(gè)體是否攜帶突變,增加或減少發(fā)生特定疾病的機(jī)會(huì)。與癥狀前測(cè)試不同的是,陽(yáng)性結(jié)果并不一定意味著患者會(huì)產(chǎn)生這種疾病。癌癥,心血管疾病 |
研究性檢測(cè) |
測(cè)試旨在促進(jìn)對(duì)特定疾病遺傳病發(fā)病原因的科學(xué)理解,而不是為了臨床評(píng)估和管理而進(jìn)行的測(cè)試。 |
基因檢測(cè)與通常的臨床評(píng)估相比,具有許多優(yōu)勢(shì)。基因檢測(cè)的優(yōu)勢(shì)有檢測(cè)是傷的,診斷正確性高,存在對(duì)一些可治好的疾病進(jìn)行早期診斷并進(jìn)行預(yù)防性干預(yù)的機(jī)會(huì)?;驒z測(cè)也有可能提供其他臨床檢測(cè)無(wú)法提供的有用信息,特別是涉及其他家庭成員的風(fēng)險(xiǎn)和未來(lái)疾病的易感性。然而,基因檢測(cè)只是構(gòu)成完整心血管臨床評(píng)估的許多組成 部分之一。詳細(xì)的家族史、體格檢查或常規(guī)生化、心血管成像或電生理研究都是臨床評(píng)估中可以提供豐富信息的手段。在合適的情況下,可以通過(guò)通過(guò)基因檢測(cè)來(lái)加強(qiáng)。
基因檢測(cè)前的考慮內(nèi)容:表型拷貝、基因拷貝、不有效外顯率和表型差異化
在考慮進(jìn)行基因檢測(cè)之前,對(duì)于需要檢測(cè)的疾病,應(yīng)對(duì)先證者進(jìn)行盡可能正確的診斷,這一點(diǎn)很重要。例如,LQTS表型,如藥物誘導(dǎo)的QT延長(zhǎng),或基因拷貝(如兒茶酚胺能多態(tài)性室性心動(dòng)過(guò)速的存在可能會(huì)阻礙基因檢測(cè)工作,因?yàn)樗鼈冊(cè)诓∫蛏吓c該疾病不同。同樣復(fù)雜的是不有效外顯率和表型差異化。在許多情況下,當(dāng)這些因素存在時(shí),詳細(xì)了解患者的家族史可能有助于發(fā)現(xiàn)這些問(wèn)題 。
基因檢測(cè)的選擇
選擇基因檢測(cè)的先決條件是了解需要檢測(cè)的疾病的可能的遺傳原因。由于通道病和心肌病通常由致病性核苷酸變異而不是大的染色體或生化異常引起,分子遺傳檢測(cè)方法(方框I)與治療法這些疾病醫(yī)生賊為相關(guān)。有關(guān)通道病和心肌病相關(guān)基因的總結(jié),請(qǐng)參閱下表。
基因檢測(cè)的結(jié)果是否用
在評(píng)估基因測(cè)試的效用時(shí),許多與傳統(tǒng)臨床測(cè)試相同的考慮因素同樣適用,包括有效性、結(jié)果解釋方式、相關(guān)成本和是否可以進(jìn)行檢測(cè)。
分析檢測(cè)和臨床檢測(cè)的有效性及陽(yáng)性預(yù)測(cè)值
對(duì)于基因檢測(cè)來(lái)說(shuō),分析有效性是指當(dāng)基因變異確實(shí)存在時(shí),能夠正確檢測(cè)到該變異(敏感性),而當(dāng)基因變異真正缺失(特異性)時(shí),則能夠排除該變異。同樣重要的是,基因檢測(cè)將臨床表型與檢測(cè)到的遺傳變異的匹配程度如何(臨床有效性)。總的來(lái)說(shuō),分析有效性和臨床有效性可作為基因檢測(cè)質(zhì)量和效用的衡量標(biāo)準(zhǔn),并可作為確定基因檢測(cè)適當(dāng)性或選擇特定檢測(cè)方法的有用工具。檢測(cè)的陽(yáng)性預(yù)測(cè)值(PPV)是檢測(cè)結(jié)果呈陽(yáng)性的患者中真正患有該疾病的比例。雖然明顯類似于敏感性,但陽(yáng)性預(yù)測(cè)值的不同之處在于,它是一種來(lái)自突變陽(yáng)性個(gè)體庫(kù)而非患者庫(kù)的測(cè)量值。由于為同一基因提供檢測(cè)的不同實(shí)驗(yàn)室可能使用不同的技術(shù),因此應(yīng)優(yōu)先選擇提供高有效性和陽(yáng)性預(yù)測(cè)值的質(zhì)量高效的第三方醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室。
解釋基因檢測(cè)結(jié)果的障礙
兩個(gè)主要問(wèn)題阻礙了心血管疾病的基因檢測(cè)。首先,在許多情況下,只有家族史和臨床表型高度提示遺傳原因的少數(shù)病例,才可以通過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)方法確定遺傳原因。例如,據(jù)估計(jì)在家族性擴(kuò)張型心肌?。‵DC)家族中,只有四分之一到三分之一的遺傳原因被確定。HCM(家族性疾病中的30%-40%或更高)或通道?。↙QTS13中的65%-75%)的遺傳原因比例更高。第二,許多心血管疾病表現(xiàn)出明顯的位點(diǎn)異質(zhì)性,具有跨許多不同基因的致病突變。例如,在家族性擴(kuò)張型心肌病FDC中,已經(jīng)確定了20多種不同基因的突變,但如上所述,這仍然只能解釋一小部分疾病的遺傳原因。這種異質(zhì)性使基因檢測(cè)策略復(fù)雜化,因?yàn)樵S多基因必須測(cè)序,增加了分析的總體成本和復(fù)雜性。由于這些問(wèn)題,雖然陽(yáng)性檢測(cè)結(jié)果可以提供非常豐富的信息,但在沒(méi)有先前確定的家族突變的情況下,陰性結(jié)果不能排除家族中的遺傳疾病,并且臨床實(shí)用性有限。而新近出現(xiàn)的基因解碼技術(shù),通過(guò)擴(kuò)大測(cè)序檢測(cè)方案和應(yīng)用不同于數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)的結(jié)構(gòu)功能分析方法,大幅度提高了分析結(jié)果的陽(yáng)性率。
患者的基因檢測(cè)與高危親屬的檢測(cè)
基因檢測(cè)有助于對(duì)先證者的診斷。它還可以促進(jìn)親屬的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估。除特殊情況外,基因檢測(cè)總是從患有賊明顯疾病的家庭成員(通常是指示病例)開(kāi)始,因?yàn)閷?duì)這個(gè)人進(jìn)行檢測(cè)將賊大可能發(fā)現(xiàn)突變。如果未檢測(cè)到突變,則對(duì)該家族中的相同基因進(jìn)行進(jìn)一步檢測(cè)通常是無(wú)用的。如果在患者受檢測(cè)到致病突變,可以對(duì)疑似攜帶者進(jìn)行有針對(duì)性的突變分析,這可能為疾病治療和生育選安排提供重要信息。
基因檢測(cè)結(jié)果中的意義未明(未知意義)
除了陽(yáng)性或陰性結(jié)果外,基因測(cè)試還可能證明存在一種基因變異,而這種變異的證據(jù)太少,無(wú)法將其歸類為致病或良性。這些結(jié)果通常被稱為意義未知的變異(VUS),具有不確定的臨床相關(guān)性,對(duì)患者治療構(gòu)成重大挑戰(zhàn)。廣泛的家族史和/或證明變異與疾病共分離可以支持致病性,功能分析也可以顯示基因變異所導(dǎo)致的蛋白質(zhì)功能的改變。關(guān)于基因突變影響蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)或幫助編碼位于蛋白質(zhì)進(jìn)化保守區(qū)的氨基酸的知識(shí)也可以是支持性的,但不是決定性的。盡管基因研究可能能夠進(jìn)一步深入了解特定VUS的意義,但在許多情況下,測(cè)試結(jié)果對(duì)臨床環(huán)境的幫助可能微乎其微。而功能分析是基因解碼所采取的一種有效的途徑。
(責(zé)任編輯:佳學(xué)基因)