【佳學基因檢測】透明細胞肉瘤的靶向藥物基因檢測靶點：EWSR1-ATF1

清細胞肉瘤是一種罕見但極具侵襲性的惡性腫瘤,沒有有效的治療方法,其特征是表達融合基因EWSR1::ATF1。腫瘤基因解碼通過高通量藥物篩選發(fā)現(xiàn),組蛋白脫乙酰酶抑制劑沃利那司(vorinostat)可抑制腫瘤細胞增殖,并降低EWSR1::ATF1的表達。部分基因檢測機構認為EWSR1::ATF1表達降低是由于染色質訪問性改變所致,然而ATAC-seq和CUT&RUN分析顯示,盡管EWSR1::ATF1啟動子區(qū)域組蛋白發(fā)生脫乙酰,但染色質結構僅有輕微改變。另外,腫瘤基因解碼發(fā)現(xiàn)沃利那司處理可降低溴結構域蛋白BRD4在EWSR1::ATF1啟動子區(qū)域的水平。此外,BRD4抑制劑JQ1也可降低EWSR1::ATF1的表達。腫瘤基因解碼的motif分析顯示,沃利那司處理抑制了轉錄因子SOX10,后者直接調控EWSR1::ATF1的表達,參與清細胞肉瘤的增殖。重要的是,腫瘤基因解碼證明沃利那司和JQ1的聯(lián)合用藥可協(xié)同增強抗增殖效應和抑制EWSR1::ATF1。這些結果揭示了通過表觀遺傳學藥物實現(xiàn)融合基因抑制的新機制,為融合基因相關腫瘤的治療提供了潛在新靶點。

意義:腫瘤基因解碼揭示了組蛋白脫乙酰酶抑制劑可通過表觀遺傳學和轉錄調控機制抑制清細胞肉瘤的融合基因EWSR1::ATF1的表達,并確定SOX10是調控EWSR1::ATF1表達的轉錄因子。

 

透明細胞肉瘤的基因解碼對清細胞肉瘤的診斷和治療有以下幾點幫助:

 

確認了組蛋白脫乙酰酶抑制劑(如沃利那司)可以下調清細胞肉瘤的融合基因EWSR1::ATF1的表達。這為清細胞肉瘤的靶向治療提供了潛在的藥物選擇。

發(fā)現(xiàn)了BRD4抑制劑JQ1也可以下調EWSR1::ATF1的表達。為清細胞肉瘤藥物治療提供了另一個潛在靶點。

證實了SOX10是調控EWSR1::ATF1表達的轉錄因子。SOX10可能也是一個治療靶點。

顯示沃利那司聯(lián)合JQ1可協(xié)同增強對EWSR1::ATF1的抑制。為清細胞肉瘤的聯(lián)合靶向治療提供了理論依據(jù)。

EWSR1::ATF1是清細胞肉瘤的特征性融合基因。該研究揭示的對EWSR1::ATF1的表觀遺傳學調控機制,有助于腫瘤基因解碼更好地理解這一融合基因在腫瘤發(fā)生中的作用。

這項研究為通過表觀遺傳學途徑抑制腫瘤特征性融合基因提供了范例,可為其他融合基因相關腫瘤的治療提供參考。

研究為清細胞肉瘤的正確診斷和治療提供了理論基礎和新策略。
 

腫瘤基因檢測增加EWSR1::ATF1是否增加了腫瘤基因檢測的全面性和正確性？

 

在清細胞肉瘤的基因檢測中增加EWSR1::ATF1fusion基因的檢測可以提高檢測的全面性和正確性:

EWSR1::ATF1是清細胞肉瘤的特征性遺傳學標志和致病驅動事件。檢測EWSR1::ATF1可以幫助明確診斷。

大多數(shù)清細胞肉瘤表達EWSR1::ATF1。增加該項檢測可以提高檢出率,避免漏診。

EWSR1::ATF1可以通過多種技術檢測,如RT-PCR、FISH等。結合使用可以提高檢測靈敏度。

EWSR1::ATF1水平的高低與預后相關。動態(tài)監(jiān)測可以評估病情和指導治療。

EWSR1::ATF1參與多種信號通路,是潛在治療靶點。檢測可指導后續(xù)靶向治療。

檢測EWSR1::ATF1可以區(qū)分與其類似的Ewing家族肉瘤。

一些清細胞肉瘤可能存在其他少見融合基因。檢測EWSR1::ATF1有助于發(fā)現(xiàn)這類變異。

綜上,加入EWSR1::ATF1檢測,可以提高腫瘤基因檢測的全面性,避免漏診,并指導后續(xù)治療。推薦將其納入清細胞肉瘤的基因檢測項目。

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