【佳學基因檢測】如何采用新的基因檢測技術(shù)提高對多發(fā)性骨髓瘤復雜基因變化的基因檢測和解析?
多發(fā)性骨髓瘤 (MM) 是一種血液惡性腫瘤,影響終末分化的 B 系細胞,其特征是骨髓中克隆性漿細胞的積累。它具有復雜的基因序列變化模式,被認為會導致該疾病在治療反應和總體結(jié)果方面的多樣性。新療法的引入顯著提高了生存率。然而,盡管取得了這些進步,但該疾病基本上仍然無法治好,并且具有高風險畸變的患者繼續(xù)表現(xiàn)出不良結(jié)果。因此,為了更好的制定治療方案,需要通過更為精細的基因檢測識別高?;颊卟⒘私鉂撛诘?a href='http://m.lucasfraser.com/cp/fenxian/' target='_blank'>疾病生物學。這是基因解碼基因檢測在正確醫(yī)學時代所能發(fā)揮的獨具特色的作用。
從《血液病患者的基因檢測多樣性》得知,根據(jù)發(fā)生在基因序列上的主要特征性變化,多發(fā)性骨髓瘤(MM) 主要分為超二倍體 (HRD) 和非 HRD 病例。在這個分類中,HRD多發(fā)性骨髓瘤的特征是奇數(shù)染色體的多重三體性,而非 HRD多發(fā)性骨髓瘤與免疫球蛋白重鏈 (IGH) 易位相關(guān)。最常見的 IGH 易位包括 t(4;14)、t(11;14)、t(6;14)、t(14;16) 和 t(14;20),它們通過與強 Eμ 和3' 調(diào)節(jié)區(qū) (RR) IGH 增強子分別引起多發(fā)性骨髓瘤SET/FGFR3、CCND1、CCND3、MAF 和 MAFB 的失調(diào)。傳統(tǒng)上,這些原發(fā)性異常以及與不良結(jié)果相關(guān)的常見繼發(fā)性事件(包括 17p 缺失、1q21 擴增和MYC易位),已在臨床常規(guī)中使用熒光原位雜交(FISH)基因檢測進行了研究。盡管啟動事件看似簡單的二分法,但下一代測序揭示了遺傳畸變的復雜情況,導致一些基因檢測方法只能識別某些特定的基因突變。這種基因序列變化的復雜情況通常包含一系列繼發(fā)性遺傳畸變,具有頻繁的拷貝數(shù)變異 (CNV)、單核苷酸變異 (SNV) 和結(jié)構(gòu)變異 (SV),這些變異是由模板化插入、局灶性擴增、染色體復雜性、染色體碎裂或其他復雜的重排所引起??偟膩碚f,這些畸變會影響漿細胞分化、細胞周期調(diào)節(jié)、DNA 修復和多種信號通路,從而使得每一種情況需要特定的靶向藥物來治療,這是多發(fā)性骨髓瘤高效治療并改善結(jié)果對基因檢測所提出的純需求。血液科腫瘤基因解碼正在努力鑒定各種可開發(fā)靶向藥物的基因突變、畸變類型。正時由于藥物研發(fā)與基于高通量測序的基因解碼結(jié)俁在一起,創(chuàng)造了使用個性化醫(yī)學策略治療多發(fā)性骨髓瘤的可能性。
Linked-read 全基因組測序 (lrWGS) 是佳學基因檢測、基因解碼正在開發(fā)的一項新的基因測序技術(shù),可以從傳統(tǒng)的短讀長測序中創(chuàng)建合成長讀長。鏈接讀取數(shù)據(jù)是通過生成源自單個高分子量 (HMW) DNA 分子的讀取組或讀取云來實現(xiàn)的,它們都帶有將它們連接在一起的通用條形碼。將讀取云映射在一起并隨后利用讀取云中 SNV 的存在,可以改進大相塊的映射和單倍型重建。lrWGS 數(shù)據(jù)進一步提供了通過分析跨越染色體斷點的讀取云來識別和重建 SV 的能力。一些研究已經(jīng)有效地使用 lrWGS 來識別和描述各種癌癥和其他疾病中通常很復雜的 SV。這使得 lrWGS 成為在多發(fā)性骨髓瘤和其他具有復雜基因組的疾病中提供全面基因信息的有吸引力的選擇。
佳學基因檢測可以直接在經(jīng)過熒光激活細胞分選 (FACS) 的變性細胞上生成高質(zhì)量的 lrWGS,而無需事先進行 DNA 純化。在概念驗證研究中將其應用于多發(fā)性骨髓瘤,血液病復雜基因變化的高精度基因檢測發(fā)現(xiàn) lrWGS 高效地檢測到 FISH 基因檢測可以檢出的易位和 CNV。此外,佳學基因新開發(fā)的全基因測序技術(shù)lrWGS 允許識別和解析各種基因信息的結(jié)構(gòu)性變化,包括個體獨特性結(jié)構(gòu)變化,對患者個體的治療和預后都有積極的影響。
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