【佳學基因檢測】Linked-read全基因組測序(lrWGS)如何改善多發(fā)性骨髓瘤的基因檢測結果
多發(fā)性骨髓瘤 (MM) 是一種無法治好的侵襲性漿細胞惡性腫瘤,其特征是細胞核染色全具有多種結構變異 (SV) 和拷貝數(shù)變異 (CNV) 。Linked-read 全基因組測序是佳學基因不斷采用的一種新型基因序列檢測技術,簡稱lrWGS。lrWGS通過提供來自標準短讀長測序的遠程遺傳信息,允許對結構變異 (SV) 進行精細檢測和重建。這使得 lrWGS 成為獲取多發(fā)性骨髓瘤完整基因組復雜性的有吸引力的解決方案。多發(fā)性骨髓瘤的深度基因檢測及大數(shù)據(jù)分析表明高質(zhì)量的 lrWGS 數(shù)據(jù)可以從經(jīng)過熒光激活細胞分選 (FACS) 的少量細胞中生成,無需 DNA 純化。使用這一測序方案,多發(fā)性骨髓瘤的深度基因檢測及大數(shù)據(jù)分析使用 lrWGS 分析了 37 名多發(fā)性骨髓瘤患者在熒光激活細胞分選 (FACS)后的多發(fā)性骨髓瘤細胞。多發(fā)性骨髓瘤的深度基因檢測及大數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn) lrWGS 和熒光原位雜交 (FISH) 在檢測反復性易位和拷貝數(shù)變異 (CNV)方面具有高度一致性。在 FISH 可以檢測的區(qū)域之外,多發(fā)性骨髓瘤的深度基因檢測及大數(shù)據(jù)分析在隊列中發(fā)現(xiàn)了超過 150 個額外的結構變異 (SV) 和拷貝數(shù)變異 (CNV)。對 lrWGS 數(shù)據(jù)的分析允許解析影響 MYC 和 t(11;14) 位點的不同結構變異 (SV)的結構,這些結構引起基因和基因調(diào)控元件的復制。此外,多發(fā)性骨髓瘤的深度基因檢測及大數(shù)據(jù)分析確定了個體結構變異 (SV)導致反復參與 IGH 基因座易位的基因失調(diào),并表明這些基因信息的獲取可以改變多發(fā)性骨髓瘤的分子分類??偟膩碚f,多發(fā)性骨髓瘤的深度基因檢測及大數(shù)據(jù)分析得出結論,lrWGS 允許檢測對多發(fā)性骨髓瘤預后至關重要的畸變,并為提供全面的遺傳學基因檢測提供了可行的途徑。實施 lrWGS 可以提供更正確的臨床預后,促進基因組醫(yī)學計劃,并大大改善臨床試驗中患者的分層。